După ce își încheie antrenamentul, Link începe călătoria în căutarea Săgeților rămase. Între timp, Ganondorf continuă să caute Prințesa Zelda și să plănuiască să-l captureze pe Link cu ajutorul vrăjitoarelor cunoscute sub numele de Twinrova. La îndemnul misteriosului Sheik, Link intră în Pustiul Bântuit pentru a o găsi pe Zelda. Călătoria va fi periculoasă, dar Link este hotărât să înfrunte capcanele Twinrovei și să supraviețuiască pentru a se confrunta cu Ganondorf într-o bătălie finală epică!